EMBL, Grenoble "Structural basis for sequence-independent substracte selection by eukaryotic wobble base tRNA deaminase ADAT2/3" Nature Communication2022, 13, 6737 https://doi.org/10.1038/s41467-022-34441-z Dolce L.G., Zimmer A.A., Tengo L., Weis F., Rubio M.A.T., Alfonzo J.D. & Kowalinski E.
Cv
Luciano Dolce est un biologiste structural de 31 ans. Il s'intéresse à l'édition et à la modification des ARN, et plus particulièrement aux complexes protéiques qui les régulent. Il a fait son doctorat au Brésil, au LNBio - Laboratório Nacional de Biociências, en appliquant la cristallographie et les techniques biophysiques pour étudier les complexes protéine-protéine. Après son doctorat, il a déménagé à Grenoble pour travailler comme chercheur post-doctorant dans le groupe d'Eva Kowalinski à l'EMBL, où il utilise la cryo-microscopie électronique pour mieux comprendre l'édition et les modifications de l'ARN chez le parasite Trypanosome brucei.
Contact
Luciano DOLCE
EMBL Grenoble
71 avenue des Martyrs
38000 Grenoble
twitter @LgDolce
Résumé de l'article
The essential deamination of adenosine A34 to inosine at the wobble base is the individual tRNA modification with the greatest effects on mRNA decoding, empowering a single tRNA to translate three different codons. To date, many aspects of how eukaryotic deaminases specifically select their multiple substrates remain unclear. Here, using cryo-EM, we present the structure of a eukaryotic ADAT2/3 deaminase bound to a full-length tRNA, revealing that the enzyme distorts the anticodon loop, but in contrast to the bacterial enzymes, selects its substrate via sequence-independent contacts of eukaryote-acquired flexible or intrinsically unfolded motifs distal from the conserved catalytic core. A gating mechanism for substrate entry to the active site is identified. Our multi-step tRNA recognition model yields insights into how RNA editing by A34 deamination evolved, shaped the genetic code, and directly impacts the eukaryotic proteome.
