Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire


Amna ASIF-LAIDIN - SEPTEMBRE 2020

Université de Paris,Institut de recherche Saint-Louis, Inserm-CNRS, Paris, France

"A small targeting domain in Ty1 integrase is sufficient to direct retrotransposon integration upstream of tRNA genes "EMBO Journal 2020 e104337 doi.org/10.15252/embj.2019104337Asif-Laidin A, Conesa C, Bonnet A , Grison C, Adhya I , Menouni R , Fayol H , Palmic N , Acker J and Lesage P.

 

Cv

Amna Asif-Laidin, 34 ans, est actuellement en stage post-doctoral dans l’équipe « Genome Biology: From mobile DNA to chromosome dynamics » dirigée par Pascale Lesage et Emmanuelle Fabre à l’Institut de Recherche Saint-Louis (Inserm U944-CNRS/Univ de Paris UMR7212). Au cours de son doctorat réalisé sous la direction de Laure Teysset à l’Institut de Biologie Paris-Seine, elle a étudié la répression des éléments transposables, par de petits ARN non codants, dans la lignée germinale de la drosophile. Ses travaux de recherche se focalisent maintenant sur l’étude des bases moléculaires permettant la sélection des sites d’intégration du rétrotransposon Ty1 au sein du génome de la levure Saccharomyces cerevisiae. Une publication précédente avait décrit le rôle clé joué par l’interaction entre l’intégrase de Ty1 et la protéine AC40 de l’ARN polymérase III dans la préférence d’intégration de Ty1 en amont des gènes transcrits par l’ARN polymérase III (Pol III).

Les travaux publiés par Amna Asif-Laidin et ses collaborateurs identifient six acides aminés consécutifs de l’intégrase nécessaires à l’interaction avec AC40 et dévoilent que ce court domaine permet à l’intégrase d’être recrutée à l’ensemble des gènes transcrits par Pol I et Pol III car AC40 est commune aux deux polymérases. Cependant, l'intégration n’a lieu qu’au niveau des gènes transcrits par Pol III suggérant l’intervention de facteurs supplémentaires (chromatine ou cofacteurs spécifiques de la Pol III) dans la sélectivité d’intégration de Ty1. L’étude montre également qu’il est possible de conférer la spécificité d’intégration de Ty1 au rétrotransposon Ty5 en introduisant dans la séquence intégrase de Ty5 le domaine d’interaction avec AC40.

Contact

Genome Biology (GeBi) TeamGenomes and Cell Biology of Diseases Lab
INSERM U944, CNRS UMR7212,
Institut de Recherche Saint-Louis

1 avenue Claude Vellefaux

750010 Paris Cedex 10 FRANCE

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Résumé de l'article

Integration of transposable elements into the genome is mutagenic. Mechanisms targeting integrations into relatively safe locations, hence minimizing deleterious consequences for cell fitness, have emerged during evolution. In budding yeast, integration of the Ty1 LTR retrotransposon upstream of RNA polymerase III (Pol III)-transcribed genes requires interaction between Ty1 integrase (IN1) and AC40, a subunit common to Pol I and Pol III. Here, we identify the Ty1 targeting domain of IN1 that ensures (I) IN1 binding to Pol I and Pol III through AC40, (ii) IN1 genome-wide recruitment to Pol I- and Pol III-transcribed genes, and (iii) Ty1 integration only at Pol III-transcribed genes, while IN1 recruitment by AC40 is insufficient to target Ty1 integration into Pol I-transcribed genes. Swapping the targeting domains between Ty5 and Ty1 integrases causes Ty5 integration at Pol III-transcribed genes, indicating that the targeting domain of IN1 alone confers Ty1 integration site specificity.