Architecture et Réactivité de l'ARN, CNRS, Université de Strasbourg, Strasbourg, France A multifaceted small RNA modulates gene expression upon glucose limitation in Staphylococcus aureus EMBO J. 2019 Feb 13. pii: e99363. doi: 10.15252/embj.201899363 Bronesky D♯, Desgranges E♯, Corvaglia A, François P, Caballero CJ, Prado L, Toledo-Arana A, Lasa I, Moreau K, Vandenesch F, Marzi S, Romby P*, Caldelari I*
Cv
Emma Desgranges, 26 ans, a obtenu un master de Biologie des Micro-organismes avec la spécialité « Microbiologie » à l’Université de Strasbourg en 2016. Actuellement elle prépare un doctorat, sous la direction d’Isabelle Caldelari et de Pascale Romby (IBMC, CNRS, Université de Strasbourg), visant à caractériser la fonction des ARN régulateurs (sARN) dans le métabolisme et la virulence de la bactérie pathogène Staphylococcus aureus. Une partie de ces travaux en collaboration avec Delphine Bronesky a montré que le sARN RsaI est induit lorsque la concentration en glucose diminue dans le milieu extracellulaire et que la croissance est arrêtée. En interagissant avec ses ARNm cibles ou d’autres ARN régulateurs, il permet à la bactérie de modifier son métabolisme face aux changements environnementaux. Cette étude a abouti à la publication de l’article intitulé « A multifaceted small RNA modulates gene expression upon glucose limitation in Staphylococcus aureus» dans le journal EMBO Journal le 21 Janvier 2019.
Résumé de l'article
Pathogenic bacteria must rapidly adapt to ever‐changing environmental signals resulting in metabolism remodeling. The carbon catabolite repression, mediated by the catabolite control protein A (CcpA), is used to express genes involved in utilization and metabolism of the preferred carbon source. Here, we have identified RsaI as a CcpA‐repressed small non‐coding RNA that is inhibited by high glucose concentrations. When glucose is consumed, RsaI represses translation initiation of mRNAs encoding a permease of glucose uptake and the FN3K enzyme that protects proteins against damage caused by high glucose concentrations. RsaI also binds to the 3′ untranslated region of icaR mRNA encoding the transcriptional repressor of exopolysaccharide production and to sRNAs induced by the uptake of glucose‐6 phosphate or nitric oxide. Furthermore, RsaI expression is accompanied by a decreased transcription of genes involved in carbon catabolism pathway and an activation of genes involved in energy production, fermentation, and nitric oxide detoxification. This multifaceted RNA can be considered as a metabolic signature when glucose becomes scarce and growth is arrested.
