Laboratoire de Biochimie Pharmaceutique- Inserm U835 Insights into the regulation of small RNA expression: SarA represses the expression of two sRNAs in Staphylococcus aureus. Nucleic Acids Research 2016 Sep 4. pii: gkw777T. Mauro, A. Rouillon and B. Felden.
Cv
Doctorant de 25 ans, j’ai obtenu une licence de Biochimie/Biologie Moléculaire à l’Université de Nantes. Mes études se sont poursuivies à l’Université de Rennes I dans le Master Sciences Cellulaires et Moléculaires du Vivant où j’ai pu continuer à m’intéresser à la régulation génétique dans le monde eucaryote et procaryote. J’effectue mon doctorat à la faculté de Pharmacie de l’Université de Rennes I dans le laboratoire de Biochimie Pharmaceutique, lequel étudie principalement les ARN régulateurs des staphylocoques dorés. Ma thèse, co-dirigée par le Pr. Brice FELDEN et le Dr. Astrid ROUILLON, s’articule autour de l’étude de la régulation transcriptionnelle de gènes transcrits en ARN régulateurs. Nous avons pu montrer, dans cet article, la répression par le facteur de transcription SarA de l’expression de deux ARN régulateurs, Srn_9340 et SprC, le dernier étant décrit comme un ARN impliqué dans l’atténuation de la virulence de S. aureus.
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Laboratoire de Biochimie Pharmaceutique - Inserm U835
Université de RENNES 1
Résumé de l'article
The opportunistic pathogen Staphylococcus aureus expresses transcription factors (TFs) and regulatory small RNAs (sRNAs) which are essential for bacterial adaptation and infectivity. Until recently, the study of S. aureus sRNA gene expression regulation was under investigated, but it is now an expanding field. Here we address the regulation of Srn_3610_SprC sRNA, an attenuator of S. aureus virulence. We demonstrate that SarA TF represses srn_3610_sprC transcription. DNase I footprinting and deletion analyses show that the SarA binding site on srn_3610_sprC belongs to an essential 22 bp DNA region. Comparative analysis also revealed another possible site, this time in the srn_9340 promoter. SarA specifically binds these two sRNA promoters with high affinity in vitro and also represses their transcription in vivo Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays confirmed SarA attachment to both promoters. ChIP and electrophoretic mobility shift assays targeting σA RNA polymerase subunit or using bacterial RNA polymerase holoenzyme suggested that SarA and the σA bind srn_3610_sprC and srn_9340 promoters in a mutually exclusive way. Beyond the mechanistic study of SarA repression of these two sRNAs, this work also suggests that some S. aureus sRNAs belong to the same regulon and act jointly in responding to environmental changes.
