Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire


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Stage de Master

Institut de la Vision

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L’équipe « Inflammation, dégénérescence et remodelage vasculaire dans les pathologies rétiniennes » dirigée par le Dr Florian SENNLAUB au sein du l’institut de la vision recherche un stagiaire pour un projet de 6 mois. Le stage sera réalisé dans cadre de la recherche d’une molécule thérapeutique pour le traitement de la forme sèche de la DMLA, basée sur l’interaction d’une protéine avec un récepteur cible. Plusieurs approches complémentaires sont envisagées et donc plusieurs projets sont possibles.


1) Amélioration de l’efficacité de peptides ou recherche d’une protéine recombinante en utilisant des techniques de display.
Les techniques de display sont utilisées en évolution dirigée de protéines pour générer une banque de peptides ou protéines mutants physiquement liés à la séquence nucléique les codants. Les mutants sont mis en présence de la molécule cible afin de ne retenir que les peptides ou protéines interagissant avec elle. Une fois les protéines récupérées, on peut séquencer l’ADN codant pour les protéines sélectionnées et déterminer les caractéristiques communes aux meilleurs candidats.
2) Etude de l’interaction spécifique entre la protéine et son récepteur.
Insertion de mutations dans le récepteur cellulaire pour déterminer les acides aminés essentiels à l’interaction.
3) Design rationnel de protéine thérapeutique.
Construction de protéines recombinantes à partir de fractions de plusieurs protéines pour obtenir les caractéristiques d’interaction, de stabilité et d’oligomérisation recherchées.


Techniques utilisées : Culture cellulaire, microbiologie, technique de display de protéines, évolution dirigée, production et purification de protéines, biologie moléculaire, bio-informatique, analyse de données NGS, cyrtométrie en flux, FACS

Profil du candidat : Etudiant en Master, expérience souhaitable en biochimie et biologie moléculaire, motivé et organisé, bonne capacité d’assimilation de la bibliographie

Internship project:
Our team is working on the discovery of a therapeutic molecule to treat atrophic AMD based on the interaction of a protein with a target receptor. Several complementary approaches are envisioned and therefore several projects are proposed for a 6 months duration.
1) Improving peptides efficacy or recombinant protein fishing using protein display techniques. Display techniques are used in directed evolution of proteins to generate a library of mutants physically linked to their encoding nucleic acid sequence. The mutants are mixed with the target molecule to keep only those interacting with it. Once we recover the proteins, we can sequence the encoding DNA and determine the best candidates’ common characteristics.
2) Study of the specific interaction between the protein and its receptor.
Insertion of mutations in the cellular receptor to determine the amino acids essential to the interaction.
3) Rational design of therapeutic proteins.
Design and expression of recombinant proteins from parts of several proteins to obtain the targeted interaction characteristics, stability and oligomeric state.

Techniques: Cell culture, microbiology, protein display, directed evolution, production and purification of proteins, molecular biology, bio-informatic, NGS data analysis, FACS, cytometry

Applicant profile: Master student, experience in biochemistry and molecular biology, motivated and organized, experience in bibliographic study

Publiée le
18.02.2021
Chargé de dossier
Dramé-Maigné Adèle
Email du contact
Type de contrat
Stage
Lieu
Paris
Rémunération
Gratification minimale stagiaire
A pourvoir pour
01.04.2021