Laboratoire IMoPA UMR 7365 CNRS/UL - UNIVERSITÉ DE LORRAINE « Synergistic defects in pre-rRNA processing from mutations in the U3-specific protein Rrp9 and U3 snoRNA. »
Nucleic Acids Res. 2020 Apr 17;48(7):3848-3868. Clerget G, Bourguignon-Igel V, Marmier-Gourrier N, Rolland N, Wacheul L, Manival X, Charron C, Kufel J, Méreau A, Senty-Ségault V, Tollervey D, Lafontaine DLJ, Branlant C, Rederstorff M.
http://doi.org/10.1093/nar/gkaa066
Cv
Guillaume Clerget, 33 ans, a obtenu en 2010 un Master de « Biochimie, Biologie Moléculaire et Régulations Cellulaires » à l’Université de Lorraine, puis a réalisé sa thèse dans l'équipe 1 du laboratoire IMoPA à Nancy, dirigée actuellement par Bruno Charpentier et Yuri Motorin. Actuellement, il enseigne la Biochimie et la Biologie Moléculaire aux étudiants en médecine de l’Université de Lorraine à Nancy. Au cours de son doctorat, il s’est principalement intéressé à la maturation des ARN pré-ribosomiques chez la levure S. cerevisiae. Il a notamment étudié le rôle de la protéine Rrp9 de la snoRNP U3. Cette étude a abouti à la publication de l’article sélectionné qui a mis en avant les fonctions clés d’un domaine β-propeller à la surface de la protéine Rrp9 à l’origine d’un réseau d’interactions protéiques indispensables pour les fonctions du snoRNA U3. Ces résultats permettent de proposer un nouveau modèle d’interaction du snoRNA U3 avec le pré-rRNA lors des premières étapes de maturation.
Contact
Laboratoire IMoPA UMR 7365 CNRS/UL
Equipe ARN, RNP - Maturation, Structure, Fonction -
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9 Avenue de la Forêt de Haye
BP20199
54505 Vandoeuvre-lès-Nancy
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Résumé de l'article
U3 snoRNA and the associated Rrp9/U3-55K protein are essential for 18S rRNA production by the SSU-processome complex. U3 and Rrp9 are required for early pre-rRNA cleavages at sites A0, A1 and A2, but the mechanism remains unclear. Substitution of Arg 289 in Rrp9 to Ala (R289A) specifically reduced cleavage at sites A1 and A2. Surprisingly, R289 is located on the surface of the Rrp9 β-propeller structure opposite to U3 snoRNA. To understand this, we first characterized the protein-protein interaction network of Rrp9 within the SSU-processome. This identified a direct interaction between the Rrp9 β-propeller domain and Rrp36, the strength of which was reduced by the R289A substitution, implicating this interaction in the observed processing phenotype. The Rrp9 R289A mutation also showed strong synergistic negative interactions with mutations in U3 that destabilize the U3/pre-rRNA base-pair interactions or reduce the length of their linking segments. We propose that the Rrp9 β-propeller and U3/pre-rRNA binding cooperate in the structure or stability of the SSU-processome. Additionally, our analysis of U3 variants gave insights into the function of individual segments of the 5 -terminal 72nt sequence of U3. We interpret these data in the light of recently reported SSU-processome structures.
