Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire


Jonathan JAGODNIK - Novembre 2017

CNRS UMR8261, Associated with University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, IBPC, Paris Stem-Loop Structures within mRNA Coding Sequences Activate Translation Initiation and Mediate Control by Small Regulatory RNAs Molecular Cell 2017 Sep 11. doi: 10.1016/j.molcel.2017.08.015. Jagodnik J., Chiaruttini C., Guillier M.

Cv

Suite à une licence de biologie et à un master de génétique focalisé sur l'ARN et l'évolution à l'Université Pierre et Marie Curie, Jonathan Jagodnik a choisi de poursuivre ses recherches autour des ARN à l'Institut de Biologie Physico-Chimique. Il y a effectué une thèse sous la direction de Maude Guillier et Claude Chiaruttini, afin d'étudier les mécanismes de régulation post-transcriptionnelle chez Escherichia coli. Cette thèse, qui vient de s'achever, a notamment abouti à la découverte de structures secondaires activant le démarrage de la traduction au sein de régions codantes d'ARNm. Ces structures peuvent par ailleurs être ciblées par des ARN régulateurs, permettant ainsi une régulation post-transcriptionnelle de l'expression génétique. Jonathan Jagodnik a 27 ans, et s'apprête à entamer un post-doctorat dans le laboratoire de Richard Gourse à l'Université du Wisconsin (Etats-Unis), où il s'intéressera à divers mécanismes de régulation de l'expression génétique impliquant le ppGpp chez les bactéries.

Contact

Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.PhD

Régulation de l'expression génétique par l'ARN,

UMR8261, IBPC – CNRS

Paris

 

Résumé de l'article

Initiation is the rate-limiting step of translation, and in bacteria, mRNA secondary structure has been extensively reported as limiting the efficiency of translation by occluding the ribosome-binding site. In striking contrast with this inhibitory effect, we report here that stem-loop structures located within coding sequences instead activate translation initiation of the Escherichia coli fepA and bamA mRNAs involved in iron acquisition and outer membrane proteins assembly, respectively. Both structures promote ribosome binding in vitro, independently of their nucleotide sequence. Moreover, two small regulatory RNAs, OmrA and OmrB, base pair to and most likely disrupt the fepA stem-loop structure, thereby repressing FepA synthesis. By expanding our understanding of how mRNA cis-acting elements regulate translation, these data challenge the widespread view of mRNA secondary structures as translation inhibitors and show that translation-activating elements embedded in coding sequences can be targeted by small RNAs to inhibit gene expression.